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Site institutionnel d'Agrocampus OuestAGROCAMPUS OUEST

Pôle halieutique, mer et littoral

Fisheries and Aquatic Sciences Center

Guitton Jérôme
Jerome.Guitton@agrocampus-ouest.fr
Tel : +33 2 23 48 58 59


Ingénieur informaticien
Écologie halieutique


Activités

Expertise

  • Administrateur de bases de données : j'accompagne les projets de recherche dans la mise en place, l'alimentation et la dissémination des bases de données.
  • Développeur : pour implémenter des Systèmes d'Information sur les Pêches, je developpe des outils de valorisation des bases de données au travers de sites web. J'implémente notamment une application "Atlas en ligne" qui permet de produire des vues synthétiques des données disponibles. Je participe aussi au développement d'un plug-in EcoTroph pour le logiciel de modélisation écosystémique Ecopath With Ecosim. Pour cette application nous avons créé un package R (EcoTroph) disponible sur le CRAN

Poste actuel

Recherche

Thèmes de recherche actuels
Systèmes d'information des pêches

Collaborations
  • IFREMER, Département Écologie et modèles pour l'halieutique
  • IRD, UMR Ecosystèmes marins exploités, CRH, Sète, France

Domaines de compétences

Conseil et expertise

Réalisation d'expertises sur les systèmes de suivi satellitaire des activités de pêches (Mauritanie, Océan indien).

Enseignement

  • SIG et Cartographie sous R (Master 2)
  • Bases de données à caractère spatial (IFREMER, INRA, IRD, etc.)

Encadrement Master et Doctorat

Implication dans des projets de recherche et d'études
Encadrement de thèses et de Masters
Sélection de publications récentes
STEENBEEK, J. BUSZOWSKI, J. CHRISTENSEN, V. AKOGLU, E. AYDIN, K. ELLIS, N. FELINTO, D. GUITTON, J. LUCEY, S. KEARNEY, K. MACKINSON, S. PAN, M. PLATTS, M. WALTERS, C., 2016. Ecopath with Ecosim as a model-building toolbox: Source code capabilities, extensions, and variations. Ecological Modelling , 178-189

GASCUEL, D. COLL, M. FOX, C. GUENETTE, S. GUITTON, J. KENNY, A. KNITTWEIS, L. NIELSEN, J. R. PIET, G. RAID, T. TRAVERS-TROLET, M. SHEPARD, S., 2016. Fishing impact and environmental status in European seas: a diagnosis from stock assessments and ecosystem indicators. Fish and Fisheries n°1 , 31–55

COLLETER, M. VALLS, A. GUITTON, J. GASCUEL, D. PAULY, D. CHRISTENSEN, V., 2015. Global overview of the applications of the Ecopath with Ecosimmodeling approach using the EcoBase models repository. Ecological Modelling n°302 , 42-53

BEIBOU, E. GUITTON, J. BARDE, J., 2015. SICP : système d'information collaboratif pour l'environnement et la gestion durable des pêches en Mauritanie. Revue des sciences et technologies de l'information n°3 , 11-35

GASCUEL, D. COLL, M. FOX, C. GUENETTE, S. GUITTON, J. KENNY, A. KNITTWEIS, L. NIELSEN, J. R. PIET, G. RAID, T. TRAVERS-TROLET, M. SHEPARD, S., 2014. Fishing impact and environmental status in European seas: a diagnosis from stock assessments and ecosystem indicators. Fish and Fisheries , 1467-2979

GLOAGUEN, P. MAHEVAS, S. RIVOT, E. WOILLEZ, M. GUITTON, J. VERMARD, Y. ETIENNE, M.-P., 2014. An autoregressive model to describe fishing vessel movement and activity. Environmetrics n°1 , 17-28

COLLETER, M. GUITTON, J. GASCUEL, D., 2013. An Introduction to the EcoTroph R Package: Analyzing Aquatic Ecosystem Trophic Networks. The R Journal , 98-107

TRIMOREAU, E. ARCHAMBAULT, B. BRIND'AMOUR, A. LEPAGE, M. GUITTON, J. LE PAPE, O., 2013. A quantitative estimate of the function of soft-bottom sheltered coastal areas as essential flatfish nursery habitat. Estuarien, Coastal and Shelf Science n°133 , 193-205

JOUFFRE, D. BORGES, M.F. BUNDY, A. COLL, M. DIALLO, I. FULTON, E.A. GUITTON, J. LABROSSE, P. O/MOHAMED ABDELLAHI, K. MASUMBUKO, B. THIAO, D., 2010. Estimating EAF indicators from scientific trawl surveys: theoretical and practical concerns. ICES Journal of Marine Science

COLLETER, M. VALLS, A. CHRISTENSEN, V. COLL, M. GASCUEL, D. GUITTON, J. PIRODDI, C. STEENBEEK, J. BUSZOWSKI, J. PAULY, D., 2016. Chapter 9: Modelling the global oceans with the Ecopath software suite: a brief review and application example. Global Atlas of Marine Fisheries. A critical appraisal of catches and ecosystems impacts. Ed. D. Pauly and D. Zeller. Island Press , 98-109


Accès à la totalité des publications ...
GUITTON, J. DINTHEER, C. DUNN, M.R. MORIZUR, Y. TETARD, A., 2003. Atlas des pêcheries de Manche. Editions Ifremer , 216 p.

STEENBEEK, J. BUSZOWSKI, J. CHRISTENSEN, V. AKOGLU, E. AYDIN, K. ELLIS, N. FELINTO, D. GUITTON, J. LUCEY, S. KEARNEY, K. MACKINSON, S. PAN, M. PLATTS, M. WALTERS, C., 2016. Ecopath with Ecosim as a model-building toolbox: Source code capabilities, extensions, and variations. Ecological Modelling , 178-189

GASCUEL, D. COLL, M. FOX, C. GUENETTE, S. GUITTON, J. KENNY, A. KNITTWEIS, L. NIELSEN, J. R. PIET, G. RAID, T. TRAVERS-TROLET, M. SHEPARD, S., 2016. Fishing impact and environmental status in European seas: a diagnosis from stock assessments and ecosystem indicators. Fish and Fisheries n°1 , 31–55

BEIBOU, E. GUITTON, J. BARDE, J., 2015. SICP : système d'information collaboratif pour l'environnement et la gestion durable des pêches en Mauritanie. Revue des sciences et technologies de l'information n°3 , 11-35

COLLETER, M. VALLS, A. GUITTON, J. GASCUEL, D. PAULY, D. CHRISTENSEN, V., 2015. Global overview of the applications of the Ecopath with Ecosimmodeling approach using the EcoBase models repository. Ecological Modelling n°302 , 42-53

GLOAGUEN, P. MAHEVAS, S. RIVOT, E. WOILLEZ, M. GUITTON, J. VERMARD, Y. ETIENNE, M.-P., 2014. An autoregressive model to describe fishing vessel movement and activity. Environmetrics n°1 , 17-28

GASCUEL, D. COLL, M. FOX, C. GUENETTE, S. GUITTON, J. KENNY, A. KNITTWEIS, L. NIELSEN, J. R. PIET, G. RAID, T. TRAVERS-TROLET, M. SHEPARD, S., 2014. Fishing impact and environmental status in European seas: a diagnosis from stock assessments and ecosystem indicators. Fish and Fisheries , 1467-2979

TRIMOREAU, E. ARCHAMBAULT, B. BRIND'AMOUR, A. LEPAGE, M. GUITTON, J. LE PAPE, O., 2013. A quantitative estimate of the function of soft-bottom sheltered coastal areas as essential flatfish nursery habitat. Estuarien, Coastal and Shelf Science n°133 , 193-205

COLLETER, M. GUITTON, J. GASCUEL, D., 2013. An Introduction to the EcoTroph R Package: Analyzing Aquatic Ecosystem Trophic Networks. The R Journal , 98-107

JOUFFRE, D. BORGES, M.F. BUNDY, A. COLL, M. DIALLO, I. FULTON, E.A. GUITTON, J. LABROSSE, P. O/MOHAMED ABDELLAHI, K. MASUMBUKO, B. THIAO, D., 2010. Estimating EAF indicators from scientific trawl surveys: theoretical and practical concerns. ICES Journal of Marine Science

COLLETER, M. VALLS, A. CHRISTENSEN, V. COLL, M. GASCUEL, D. GUITTON, J. PIRODDI, C. STEENBEEK, J. BUSZOWSKI, J. PAULY, D., 2016. Chapter 9: Modelling the global oceans with the Ecopath software suite: a brief review and application example. Global Atlas of Marine Fisheries. A critical appraisal of catches and ecosystems impacts. Ed. D. Pauly and D. Zeller. Island Press , 98-109

CHASSOT, E. BALGUERIAS, E. GUITTON, J. JOUFFRE, D. TFEIL, B. GASCUEL, D., 2010. Diagnostic de l'état du stock de poulpe (Octopus vulgaris) mauritanien : synthèse et nouvelles évaluations par approche globale. Labrosse P. et al (éds), Evaluation des ressources et aménagement des pêcheries de la ZEE Mauritanienne. Actes du sixième Groupe de travail de l'IMROP, Nouadhibou, Mauritanie, décembre 2006. IMROP éditions , 95-116

GASCUEL, D. O/SAMBA, A. O/VALLY, Y. MEISSA, B. GUITTON, J., 2010. Evolution de l'abondance des ressources démersales en Mauritanie de 1982 à 2006. Labrosse P. et al (éds), Evaluation des ressources et aménagement des pêcheries de la ZEE Mauritanienne. Actes du sixième Groupe de travail de l'IMROP, Nouadhibou, Mauritanie, décembre 2006. IMROP Editions , 83-93

GUITTON, J. GASCUEL, D., 2005. TrawlBase-SIAP : un outil de gestion des données de campagnes de chalutage scientifique. In : Pêcheries maritimes, écosystèmes & sociétés en Afrique. Chavance P., Ba M., Gascuel D., Vakily M. et Pauly D., (éds) 3Pêcheries maritimes, écosystèmes et sociétés en Afrique de l'Ouest : un demi siècle de changement", Actes du Symposium international Dakar, Juin 2002 n°Luxembourg, Office des publications officielles des Communautés Européennes. XXXVI:15

ULRICH, C. GUITTON, J., 1999. The use of Internet for scientific modelling purposes : interest, implementation and example of application. Computers in Higher Economics Education Review

GUITTON, J. ULRICH, C. VERMARD, Y. AFONSO, P. ANDONEGI, E. ARGYROU, L. CALDERWOOD, J. FAUCONNET, L. MORATO, T. PRELLEZO, R. ROBERT, M. SAVINA-ROLLAND, M. TRIANTAPHYLLIDIS, G., 2017. DiscardLess Atlas. [on line]

GANGBAZO, H. AHOUANDJOGBE, S. DIDAVI, E.Y. GNITASSOUN, D. L. ZERBO, H. KIENOU, A. SOUBEIGA, Z. HAROUNA, S. DJIRE, F. TRAORE SHEP, H. KONAN, K. S. BARRI, I. JUMPE, R. FERREIRA CORREIA, E. CABRAL, J. DIARRA, S. TRAORE, B. SARRO, A. HAROUNA, A. HASSAN, N. OUSSEINI, K. FADIABA, O. NDAW, S. SECK, S. ALIX, A. AHOEDO, K. BEIGUE ALFA, P. CHAVANCE, P. GUITTON, J. ESCARAVAGE, C. FERREIRA, M. L., 2013. Atlas UEMOA de la pêche continentale. Programme régional de renforcement de la collecte des données statistiques des pêches dans les Etats membres.

GUITTON, J. COLLETER, M. GASCUEL, D. GATTI, P., 2012. EcoTroph modelling support.

BEIBOU, E. GUITTON, J. BARDE, J. LIBOUREL, T., 2015. Des indicateurs et des métadonnées pour les décrire : intégration au sein d'atlas géomatique en ligne. SAGEP2015. Actes de la 11ème conférence internationale annuelle Spatial Analysis and GEOmatics. Hammamet, Tunisia, November 23th, 2015 , 283-296

BEIBOU, E. GUITTON, J. LIBOUREL, T., 2014. Atlas géomatique collaboratif pour l'environnement et la gestion durable des ressources halieutiques, en Afrique de l'ouest, cas de la Mauritanie. Elaboration d'un système d'information collaboratif. Congrès INFORSID 2014, Lyon, 20-23 mai 2014

COLLETER, M. GASCUEL, D. LAM, V. GUITTON, J. CHEUNG, W. ZELLER, D. PAULY, D., 2015. Modélisation des effets de la pêche sur la biomasse de l'Océan mondial de 1950 à 2010. Colloque de l'AFH « Les écosystèmes marins dans tous leurs états », Montpellier, 1-3 Juillet 2015

GLOAGUEN, P. WOILLEZ, M. MAHEVAS, S. RIVOT, E. GUITTON, J. ETIENNE, M.-P. VERMARD, Y., 2013. Un modèle de chaîne de Markov cachées (HMM) pour décrire les trajectoires et l'activité de bateaux de pêche. 11ème Forum de l'Association Française d'Halieutique, 19-21 juin 2013, Bordeaux. Thème : « Exploitation et conservation des écosystèmes aquatiques – une question d'échelle ?»

GASCUEL, D. GUITTON, J., 2011. EcoTroph (E.T.): new case studies and developments. Ecopath Research and Consortium meeting, Vancouver, 17th-19th October 2011

GUITTON, J. SIDIBE, A. MASUMBUKO, B. BEIBOU, E. SOUMAH, M. CAUQUIL, P. CHAVANCE, P., 2007. A regional information system for improving fisheries governance and assessment, structure and contents. EBUS. June. 4-6 2008 at Las Palmas, Spain

TACONET, M. BENSCH, A. CAILLOT, S. CAROCCI, F. GUITTON, J. LLEONART, J., 2007. Tailoring Fisheries Global Information System infrastructure. Ocean Biodiversity Informatics conference. Oct. 2-4 2007 at the Bedford Institute of Oceanography

COLLETER, M. VALLS, A. GUITTON, J. MORISSETTE, L. ARREGUIN-SANCHEZ, F. CHRISTENSEN, V. GASCUEL, D. PAULY, D., 2014. EcoBase: a repository solution to gather and communicate information from EwE models. Poster, p. 206-207. Steenbeek, J., Piroddi, C., Coll, M., Heymans, J. J., Villasante, S., Christensen, V.(eds.), Ecopath30Years Conference Proceedings: Extended Abstracts. Fisheries Centre Research Reports 22(3). Fisheries Centre, University of British Columbia , 237 p.

COLLETER, M. VALLS, A. GUITTON, J. GASCUEL, D. CHRISTENSEN, V. PAULY, D., 2014. Overview of worldwide applications of the EwE approach using the EcoBase models repository. Poster p. 208-2010. Steenbeek, J., Piroddi, C., Coll, M., Heymans, J. J., Villasante, S., Christensen, V.(eds.), Ecopath30Years Conference Proceedings: Extended Abstracts. Fisheries Centre Research Reports 22(3). Fisheries Centre, University of British Columbia , 237 p.

GLOAGUEN, P. MAHEVAS, S. RIVOT, E. WOILLEZ, M. ETIENNE, M.-P. GUITTON, J. VERMARD, Y., 2013. An autoregressive model to describe fishing boat movement and activities. ICES Annual Scientific Conference, Theme Session C: Modelling human behaviour in models of marine ecosystems. Reykjavik, Island, 23-27 Sept 2013

WOILLEZ, M. GLOAGUEN, P. MAHEVAS, S. RIVOT, E. VERMARD, Y. GUITTON, J., 2013. Capturing variability of fishing activities and trajectories to improve fishing vessel behaviour modelling approaches by hidden Markov models. ICES Annual Scientific Conference, Theme Session C: Modelling human behaviour in models of marine ecosystems. Reykjavik, Island, 23-27 Sept 2013

GUITTON, J. LESUEUR, M., 2009. L'Atlas en ligne : outil de concertation et de gestion de la connaissance. 9ème Forum Halieutmétrique "Les indicateurs en halieutique : pertinence précision et robustesse", Brest

LE TIXERANT, M. GUITTON, J., 2005. Cartographie Dynamique de la règlementation des. XVIIème Rencontres Interrégionales de l'AGLIA "Initiatives et gouvernance dans la pêche et l'aquaculture". Saint Nazaire, 7 et 8 juillet 2005

COLLETER, M. VALLS, A. GUITTON, J. MORISSETTE, L. ARREGUIN-SANCHEZ, F. CHRISTENSEN, V. GASCUEL, D. PAULY, D., 2013. EcoBase: a repository solution to gather and communicate information from EwE models. Fisheries Centre Research Report (FCRR) n°1

BEZ, N. GUITTON, J., 2008. D1.2.2 Tools calculating the order of magnitude of the precision of biomass indices. Livrable ISTAM

GUITTON, J. al., 2008. D2.1 Inventory of data and meta data retained by the project and definition of specifications for the prototype of the subregional information system. Livrable ISTAM

GUITTON, J. al., 2008. D2.3 Prototype (functional) of the subregional information system. Annotated tools and case studies + D5.2 A prototype electronic atlas accessible on line. Livrable ISTAM

BEZ, N. GUITTON, J., 2008. D4.3 Documents of training session No.3 - Formation R. Livrable ISTAM

GUITTON, J. al., 2008. D2.4 Recommendations (general principles and technologies for making them) for a data policy at subregional level. Livrable ISTAM

GUITTON, J. al., 2008. D2.2 Supply of a catalogue of data and of the project's regional database including a library of geographical referenced layers (documented, standardised), compatible with the regional database. Livrable ISTAM

GUITTON, J. LESUEUR, M., 2008. Documentation technique de l'atlas en ligne. Projet Pêche et Réglementation. Pôle halieutique AGROCAMPUS OUEST , 29 p.

CHASSOT, E. BALGUERIAS, E. BENCHERIFI, S. BEZ, N. CAMARA, Y. DIALLO, I. FARAJ, A. FERNANDEZ PERALTA, L. GUITTON, J. JOUFFRE, D. MEINERS MANDUJANO, C. RAMOS, A. RIVOT, E. SANTAMARIAI, M. T. G. SIDIBE, A. THIAW, M. GASCUEL, D., 2007. Corrected pseudo-cohort analysis: Principles, interest and application in West-African fisheries. Rapport WP3 projet Européen ISTAM , 40 p.

LESUEUR, M. BOUDE, J.-P. GUITTON, J. ROPARS-COLLET, C. HUCHET-BOURDON, M., 2006. Mise en place d'un tableau de bord permettant le suivi en continu de la situation économique et sociale des entreprises de pêche maritime. Rapport final. Rapport interne DPMA , 373 p.

LESUEUR, M. BOUDE, J.-P. GUITTON, J. ROPARS-COLLET, C. HUCHET-BOURDON, M., 2006. Mise en place d'un tableau de bord permettant le suivi en continu de la situation économique et sociale des entreprises de pêche maritime. Rapport final et documentation technique. Rapport interne DPMA. Pôle halieutique Agrocampus Rennes. , 224 p. et 149 p.

CHASSOT, E. GUITTON, J. GASCUEL, D., 2006. Analyse rectifiée des pseudo-cohortes. Groupe de travail ISTAM. Activité "Modèles en environnement Data-Poor", 6-12 novembre 2006

GASCUEL, D. GUITTON, J. MEISSA, B. IDRISSI, M., 2002. Analyse des statistiques 1991/2001 de la pêche et des captures, profils de production. Rapport scientifique de la commission Evaluation des stocks démersaux , 12 p.

GASCUEL, D. GUITTON, J., 2001. Avancement du module TrawlBase. Rapport de l'atelier de Mindelo et état d'avancement du module. Mindelo , 17 p.

GUITTON, J. LE PENVEN, C., 2003. Manuel d'utilisation First-SIAP. Document technique TrawlBase n°6. Contrat européen Système d'Information et d'Analyses des Pêches "SIAP" , 52 p.


Création et mise à jour du site Catherine Le Penven et Jérôme Guitton