AGROCAMPUS OUEST - Ingénieur agronome : Spécialisations

Guitton Jérôme

Jerome.Guitton@agrocampus-ouest.fr
Tel : +33 2 23 48 58 59

Scientist
Écologie halieutique

Activities

Expertise

Database administrator: I support projects by setting up, populating, and disseminating fisheries databases.
Software developer: To manage fisheries information systems, I develop database-linked websites to enable users to access the data provided by projects. I regularly implement an online atlas to disseminate an organised view of the data I manage. I am also involved in the development of the popular Ecopath software for ecosystem modelling.

Current Position

Member of the Fisheries and Aquatic Science centre of Agrocampus Ouest
Member of the Ecology and System Health research unit, Fisheries and Aquatic Ecology research team

Research

Current Research Topics

Fisheries information systems

Collaborations

IFREMER, Département Ecologie et modèles pour lhalieutique
IRD, UMR Ecosystèmes marins exploités, CRH, Sète, France

Specialities

Consulting Experience

Studies in managing vessel monitoring systems (Mauritania, Indian Ocean)

Teaching Experience

I teach students courses on Geographic Information Systems and data management to elaborate maps with softwares such as R or Qgis; Masters degree in fisheries sciences.
I teach scientists to use spatial database potential. The use of the Postgis extension of Postgres to fisheries supports these courses. (IFREMER, INRA, IRD, etc.).

M.Sc. and Ph.D. Supervision

Participation to the projects of the research unit

ECOTROPH::Un modèle de flux trophiques pour l'évaluation des impacts de la pêche sur les écosystèmes aquatiques

ECOBASE:: Une base de données pour collecter et rendre accessible les données des modèles écosystémiques Ecopath with Ecosim (EWE)

DEMERSTEM::Demersal Ecosystem (2022)

DiscardLess :: Stratégie pour une élimination progressive des rejets (2019)

Archives

Inventaire des zones fonctionnelles pour les ressources halieutiques dans les eaux sous souveraineté française (2017)

Projet Appui UEMOA :: Amélioration des statistiques de pêche (2017)

VECTORS :: Vectors of changes in marine life, impact on economic sectors (2015)

CHARM 3 :: Approche intégrée pour la gestion des ressources marines en Manche - Phase 3 (2012)

SIGDPMA :: SIG "Pêche et Réglementations" (2011)

COMTROBAIE - COMmunautés bentho-démersales et réseaux TROphiques d'une nourricerie de juvéniles de poissons d'un écosystèmes fragile, la BAIE de Vilaine (2010)

ISTAM :: Aide à l'émergence d'avis scientifiques en Afrique de l'ouest (2008)

Cartographie dynamique de la réglementation des pêches professionnelles en mer côtière (2006)

Animation des Assises Régionales de la Pêche et de l'Aquaculture (2006)

Tableau de bord socio-économique des entreprises de pêches maritimes (2006)

SIAP :: Système d'Information et d'Analyse des Pêches du Nord-Ouest (2003)

PhD and Msc supervision

BEIBOU, E., 2015. Géomatique Collaborative : mise en oeuvre d'un Système d'information pour la gestion responsable des pêches en Mauritanie.

DJESSOUHO, D. O. C., 2015. Analyse socio-économique du fumage du poisson de la pêche artisanale maritime sur le littoral du Bénin. Mémoire de Master 2, spécialité économie appliquée : agriculture, mer, environnement

Selected recent publications

OLMOS, M. PAYNE, M. NEVOUX, M. PREVOST, E. CHAPUT, G. DU PONTAVICE, H. GUITTON, J. SHEEHAN, T. MILLS, K. RIVOT, E., 2020. Spatial synchrony in the response of a long range migratory species (Salmo salar) to climate change in the North Atlantic Ocean. Global Change Biology

STEENBEEK, J. BUSZOWSKI, J. CHRISTENSEN, V. AKOGLU, E. AYDIN, K. ELLIS, N. FELINTO, D. GUITTON, J. LUCEY, S. KEARNEY, K. MACKINSON, S. PAN, M. PLATTS, M. WALTERS, C., 2016. Ecopath with Ecosim as a model-building toolbox: Source code capabilities, extensions, and variations. Ecological Modelling , 178-189

GASCUEL, D. COLL, M. FOX, C. GUENETTE, S. GUITTON, J. KENNY, A. KNITTWEIS, L. NIELSEN, J. R. PIET, G. RAID, T. TRAVERS-TROLET, M. SHEPARD, S., 2016. Fishing impact and environmental status in European seas: a diagnosis from stock assessments and ecosystem indicators. Fish and Fisheries n°1 , 3155

GLOAGUEN, P. MAHEVAS, S. RIVOT, E. WOILLEZ, M. GUITTON, J. VERMARD, Y. ETIENNE, M.-P., 2015. An autoregressive model to describe fishing vessel movement and activity. Environmetrics n°1 , 17-28

COLLETER, M. VALLS, A. GUITTON, J. GASCUEL, D. PAULY, D. CHRISTENSEN, V., 2015. Global overview of the applications of the Ecopath with Ecosimmodeling approach using the EcoBase models repository. Ecological Modelling n°302 , 42-53

BEIBOU, E. GUITTON, J. BARDE, J., 2015. SICP : système d'information collaboratif pour l'environnement et la gestion durable des pêches en Mauritanie. Revue des sciences et technologies de l'information n°3 , 11-35

GASCUEL, D. COLL, M. FOX, C. GUENETTE, S. GUITTON, J. KENNY, A. KNITTWEIS, L. NIELSEN, J. R. PIET, G. RAID, T. TRAVERS-TROLET, M. SHEPARD, S., 2014. Fishing impact and environmental status in European seas: a diagnosis from stock assessments and ecosystem indicators. Fish and Fisheries , 1467-2979

COLLETER, M. GUITTON, J. GASCUEL, D., 2013. An Introduction to the EcoTroph R Package: Analyzing Aquatic Ecosystem Trophic Networks. The R Journal , 98-107

TRIMOREAU, E. ARCHAMBAULT, B. BRIND'AMOUR, A. LEPAGE, M. GUITTON, J. LE PAPE, O., 2013. A quantitative estimate of the function of soft-bottom sheltered coastal areas as essential flatfish nursery habitat. Estuarien, Coastal and Shelf Science n°133 , 193-205

JOUFFRE, D. BORGES, M.F. BUNDY, A. COLL, M. DIALLO, I. FULTON, E.A. GUITTON, J. LABROSSE, P. O/MOHAMED ABDELLAHI, K. MASUMBUKO, B. THIAO, D., 2010. Estimating EAF indicators from scientific trawl surveys: theoretical and practical concerns. ICES Journal of Marine Science n°67 , 796-806

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Ouvrages scientifiques et direction d'ouvrages (OUV)

GUITTON, J. DINTHEER, C. DUNN, M.R. MORIZUR, Y. TETARD, A., 2003. Atlas des pêcheries de Manche. Editions Ifremer , 216 p.

Article scientifique avec comité de lecture (ACL)

GLOAGUEN, P. MAHEVAS, S. RIVOT, E. WOILLEZ, M. GUITTON, J. VERMARD, Y. ETIENNE, M.-P., 2015. An autoregressive model to describe fishing vessel movement and activity. Environmetrics n°1 , 17-28

COLLETER, M. GUITTON, J. GASCUEL, D., 2013. An Introduction to the EcoTroph R Package: Analyzing Aquatic Ecosystem Trophic Networks. The R Journal , 98-107

Partie d'ouvrage avec comité de lecture (ACLN, OS)

COLLETER, M. VALLS, A. CHRISTENSEN, V. COLL, M. GASCUEL, D. GUITTON, J. PIRODDI, C. STEENBEEK, J. BUSZOWSKI, J. PAULY, D., 2016. Chapter 9: Modelling the global oceans with the Ecopath software suite: a brief review and application example. Global Atlas of Marine Fisheries. A critical appraisal of catches and ecosystems impacts. Ed. D. Pauly and D. Zeller. Island Press , 98-109

CHASSOT, E. BALGUERIAS, E. GUITTON, J. JOUFFRE, D. TFEIL, B. GASCUEL, D., 2010. Diagnostic de l'état du stock de poulpe (Octopus vulgaris) mauritanien : synthèse et nouvelles évaluations par approche globale. Labrosse P. et al (éds), Evaluation des ressources et aménagement des pêcheries de la ZEE Mauritanienne. Actes du sixième Groupe de travail de l'IMROP, Nouadhibou, Mauritanie, décembre 2006. IMROP éditions , 95-116

GASCUEL, D. O/SAMBA, A. O/VALLY, Y. MEISSA, B. GUITTON, J., 2010. Evolution de l'abondance des ressources démersales en Mauritanie de 1982 à 2006. Labrosse P. et al (éds), Evaluation des ressources et aménagement des pêcheries de la ZEE Mauritanienne. Actes du sixième Groupe de travail de l'IMROP, Nouadhibou, Mauritanie, décembre 2006. IMROP Editions , 83-93

GUITTON, J. GASCUEL, D., 2005. TrawlBase-SIAP : un outil de gestion des données de campagnes de chalutage scientifique. In : Pêcheries maritimes, écosystèmes & sociétés en Afrique. Chavance P., Ba M., Gascuel D., Vakily M. et Pauly D., (éds) 3Pêcheries maritimes, écosystèmes et sociétés en Afrique de l'Ouest : un demi siècle de changement", Actes du Symposium international Dakar, Juin 2002 n°Luxembourg, Office des publications officielles des Communautés Européennes. XXXVI:15

Article scientifique sans comité de lecture (ASCL)

ULRICH, C. GUITTON, J., 1999. The use of Internet for scientific modelling purposes : interest, implementation and example of application. Computers in Higher Economics Education Review

Logiciels et sites Web (AP)

GUITTON, J. ULRICH, C. VERMARD, Y. AFONSO, P. ANDONEGI, E. ARGYROU, L. CALDERWOOD, J. FAUCONNET, L. MORATO, T. PRELLEZO, R. ROBERT, M. SAVINA-ROLLAND, M. TRIANTAPHYLLIDIS, G., 2017. DiscardLess Atlas. [on line]

GANGBAZO, H. AHOUANDJOGBE, S. DIDAVI, E.Y. GNITASSOUN, D. L. ZERBO, H. KIENOU, A. SOUBEIGA, Z. HAROUNA, S. DJIRE, F. TRAORE SHEP, H. KONAN, K. S. BARRI, I. JUMPE, R. FERREIRA CORREIA, E. CABRAL, J. DIARRA, S. TRAORE, B. SARRO, A. HAROUNA, A. HASSAN, N. OUSSEINI, K. FADIABA, O. NDAW, S. SECK, S. ALIX, A. AHOEDO, K. BEIGUE ALFA, P. CHAVANCE, P. GUITTON, J. ESCARAVAGE, C. FERREIRA, M. L., 2013. Atlas UEMOA de la pêche continentale. Programme régional de renforcement de la collecte des données statistiques des pêches dans les Etats membres.

GUITTON, J. COLLETER, M. GASCUEL, D. GATTI, P., 2012. EcoTroph modelling support.

Communications avec actes dans un congrès international et national (ACTI, ACTN)

BEIBOU, E. GUITTON, J. BARDE, J. LIBOUREL, T., 2015. Des indicateurs et des métadonnées pour les décrire : intégration au sein d'atlas géomatique en ligne. SAGEP2015. Actes de la 11ème conférence internationale annuelle Spatial Analysis and GEOmatics. Hammamet, Tunisia, November 23th, 2015 , 283-296

BEIBOU, E. GUITTON, J. LIBOUREL, T., 2014. Atlas géomatique collaboratif pour l'environnement et la gestion durable des ressources halieutiques, en Afrique de l'ouest, cas de la Mauritanie. Elaboration d'un système d'information collaboratif. Congrès INFORSID 2014, Lyon, 20-23 mai 2014

Communications orales sans acte dans un congrès international ou national (COM)

COLLETER, M. GASCUEL, D. LAM, V. GUITTON, J. CHEUNG, W. ZELLER, D. PAULY, D., 2015. Modélisation des effets de la pêche sur la biomasse de l'Océan mondial de 1950 à 2010. Colloque de l'AFH « Les écosystèmes marins dans tous leurs états », Montpellier, 1-3 Juillet 2015

GLOAGUEN, P. WOILLEZ, M. MAHEVAS, S. RIVOT, E. GUITTON, J. ETIENNE, M.-P. VERMARD, Y., 2013. Un modèle de chaîne de Markov cachées (HMM) pour décrire les trajectoires et l'activité de bateaux de pêche. 11ème Forum de l'Association Française d'Halieutique, 19-21 juin 2013, Bordeaux. Thème : « Exploitation et conservation des écosystèmes aquatiques une question d'échelle ?»

GASCUEL, D. GUITTON, J., 2011. EcoTroph (E.T.): new case studies and developments. Ecopath Research and Consortium meeting, Vancouver, 17th-19th October 2011

GUITTON, J. SIDIBE, A. MASUMBUKO, B. BEIBOU, E. SOUMAH, M. CAUQUIL, P. CHAVANCE, P., 2007. A regional information system for improving fisheries governance and assessment, structure and contents. EBUS. June. 4-6 2008 at Las Palmas, Spain

TACONET, M. BENSCH, A. CAILLOT, S. CAROCCI, F. GUITTON, J. LLEONART, J., 2007. Tailoring Fisheries Global Information System infrastructure. Ocean Biodiversity Informatics conference. Oct. 2-4 2007 at the Bedford Institute of Oceanography

Communication par affiche dans un congrès international ou national (AFF)

COLLETER, M. VALLS, A. GUITTON, J. MORISSETTE, L. ARREGUIN-SANCHEZ, F. CHRISTENSEN, V. GASCUEL, D. PAULY, D., 2014. EcoBase: a repository solution to gather and communicate information from EwE models. Poster, p. 206-207. Steenbeek, J., Piroddi, C., Coll, M., Heymans, J. J., Villasante, S., Christensen, V.(eds.), Ecopath30Years Conference Proceedings: Extended Abstracts. Fisheries Centre Research Reports 22(3). Fisheries Centre, University of British Columbia , 237 p.

COLLETER, M. VALLS, A. GUITTON, J. GASCUEL, D. CHRISTENSEN, V. PAULY, D., 2014. Overview of worldwide applications of the EwE approach using the EcoBase models repository. Poster p. 208-2010. Steenbeek, J., Piroddi, C., Coll, M., Heymans, J. J., Villasante, S., Christensen, V.(eds.), Ecopath30Years Conference Proceedings: Extended Abstracts. Fisheries Centre Research Reports 22(3). Fisheries Centre, University of British Columbia , 237 p.

GLOAGUEN, P. MAHEVAS, S. RIVOT, E. WOILLEZ, M. ETIENNE, M.-P. GUITTON, J. VERMARD, Y., 2013. An autoregressive model to describe fishing boat movement and activities. ICES Annual Scientific Conference, Theme Session C: Modelling human behaviour in models of marine ecosystems. Reykjavik, Island, 23-27 Sept 2013

WOILLEZ, M. GLOAGUEN, P. MAHEVAS, S. RIVOT, E. VERMARD, Y. GUITTON, J., 2013. Capturing variability of fishing activities and trajectories to improve fishing vessel behaviour modelling approaches by hidden Markov models. ICES Annual Scientific Conference, Theme Session C: Modelling human behaviour in models of marine ecosystems. Reykjavik, Island, 23-27 Sept 2013

GUITTON, J. LESUEUR, M., 2009. L'Atlas en ligne : outil de concertation et de gestion de la connaissance. 9ème Forum Halieutmétrique "Les indicateurs en halieutique : pertinence précision et robustesse", Brest

LE TIXERANT, M. GUITTON, J., 2005. Cartographie Dynamique de la règlementation des. XVIIème Rencontres Interrégionales de l'AGLIA "Initiatives et gouvernance dans la pêche et l'aquaculture". Saint Nazaire, 7 et 8 juillet 2005

Rapport scientifique (RAP)

REGIMBART, A. GUITTON, J. LE PAPE, O., 2018. Zones fonctionnelles pour les ressources halieutiques dans les eaux sous souveraineté française. Deuxième partie : inventaire. Les publications du Pôle halieutique AGROCAMPUS OUEST n°46 , 175 p.

COLLETER, M. VALLS, A. GUITTON, J. MORISSETTE, L. ARREGUIN-SANCHEZ, F. CHRISTENSEN, V. GASCUEL, D. PAULY, D., 2013. EcoBase: a repository solution to gather and communicate information from EwE models. Fisheries Centre Research Report (FCRR) n°1

BEZ, N. GUITTON, J., 2008. D1.2.2 Tools calculating the order of magnitude of the precision of biomass indices. Livrable ISTAM

GUITTON, J. al., 2008. D2.1 Inventory of data and meta data retained by the project and definition of specifications for the prototype of the subregional information system. Livrable ISTAM

GUITTON, J. al., 2008. D2.3 Prototype (functional) of the subregional information system. Annotated tools and case studies + D5.2 A prototype electronic atlas accessible on line. Livrable ISTAM

BEZ, N. GUITTON, J., 2008. D4.3 Documents of training session No.3 - Formation R. Livrable ISTAM

GUITTON, J. al., 2008. D2.4 Recommendations (general principles and technologies for making them) for a data policy at subregional level. Livrable ISTAM

GUITTON, J. al., 2008. D2.2 Supply of a catalogue of data and of the project's regional database including a library of geographical referenced layers (documented, standardised), compatible with the regional database. Livrable ISTAM

GUITTON, J. LESUEUR, M., 2008. Documentation technique de l'atlas en ligne. Projet Pêche et Réglementation. Pôle halieutique AGROCAMPUS OUEST , 29 p.

CHASSOT, E. BALGUERIAS, E. BENCHERIFI, S. BEZ, N. CAMARA, Y. DIALLO, I. FARAJ, A. FERNANDEZ PERALTA, L. GUITTON, J. JOUFFRE, D. MEINERS MANDUJANO, C. RAMOS, A. RIVOT, E. SANTAMARIAI, M. T. G. SIDIBE, A. THIAW, M. GASCUEL, D., 2007. Corrected pseudo-cohort analysis: Principles, interest and application in West-African fisheries. Rapport WP3 projet Européen ISTAM , 40 p.

LESUEUR, M. BOUDE, J.-P. GUITTON, J. ROPARS-COLLET, C. HUCHET-BOURDON, M., 2006. Mise en place d'un tableau de bord permettant le suivi en continu de la situation économique et sociale des entreprises de pêche maritime. Rapport final. Rapport interne DPMA , 373 p.

LESUEUR, M. BOUDE, J.-P. GUITTON, J. ROPARS-COLLET, C. HUCHET-BOURDON, M., 2006. Mise en place d'un tableau de bord permettant le suivi en continu de la situation économique et sociale des entreprises de pêche maritime. Rapport final et documentation technique. Rapport interne DPMA. Pôle halieutique Agrocampus Rennes. , 224 p. et 149 p.

CHASSOT, E. GUITTON, J. GASCUEL, D., 2006. Analyse rectifiée des pseudo-cohortes. Groupe de travail ISTAM. Activité "Modèles en environnement Data-Poor", 6-12 novembre 2006

GASCUEL, D. GUITTON, J. MEISSA, B. IDRISSI, M., 2002. Analyse des statistiques 1991/2001 de la pêche et des captures, profils de production. Rapport scientifique de la commission Evaluation des stocks démersaux , 12 p.

GASCUEL, D. GUITTON, J., 2001. Avancement du module TrawlBase. Rapport de l'atelier de Mindelo et état d'avancement du module. Mindelo , 17 p.

Synthèse et fiche technique

GUITTON, J. LE PENVEN, C., 2003. Manuel d'utilisation First-SIAP. Document technique TrawlBase n°6. Contrat européen Système d'Information et d'Analyses des Pêches "SIAP" , 52 p.

Création et mise à jour du site Catherine Le Penven et Jérôme Guitton